En la decada de los 50 en el municipio de El Molino Guajira existia una casa escolar como unica escuela de la poblacion ,al ir aumentando sus habitantes surgio la necesidad de crear un nuevo establecimiento de educacion basica primaria para brindar cobertura en este nivel a la poblacion de los barrios de arriba como se le ha llamado comunmente a este sector.Las tierras para dicha construccion fueron donadas por el Señor finado Antonio Rosado.
Su primer rector fue el profesor Luis Jose Jimenez Aragon quien se desempeño con gran eficacia;luego asumieron este cargo los profesores Alfonso Urbina Vega y Mario Jose Aponte Jimenez.En 1975 asumio la direccion la señora Alidis Jimenez de Zabaleta,impulsando el progreso de la institucion con gran empeño y responsabilidad.
Se desempeñaron como docentes atraves de la historia de la institucion entre otros : Josefa Mendiola (fallecida) Elsa Armenta,Jose Curiel,Luis Carrillo,Ayda Urbina,Silvio Diaz,Ledis Carolina Zabaleta,Piedad Zabaleta;Teresa Armenta,Soledad Zabaleta y Socorro Daza.
A partir de la expediccion 115 del 19994,la comunidad educativa impulsada por la administracion municipal con el Doctor Jorge Luis zabaleta Jimenez como alcalde y el Señor Carlos Olivella Aponte como secretario de educacion emprendieron el programa de implementacion de ciclo de secundaria debido a la gran necesidad de la poblacion estudiantil puesto que la gran mayoria de los estudiantes egresados de las escuelas primarias emigraban a otros municipios.Se adquirio u lote de 5 hectareas para la construccion de la nueva planta fisica se presentaron proyectos a ECOCARBON quienes con gran entusiasmo acogieron estos proyecto haciendo realidad este proposito cofinanciando con el municipio la obra que se levanto a orilla del manatial a orilla del manantial en medio de un paisaje que invita al estudio,la concentracion,la superacion espiritual moral cientifica,filosofica que infunde esta instutucion .
La implementacion de la basica secundaria se inicio en el año de 1996 con el grado sexto y cada año se continuaba con el grado siguiente.Fue asi como en el año 1999 el dia 4 de diciembre recibieron el titulo de Bachiller Basico la primera promocion.
Con el acuerdo N 007 del 26 de Mayo de 1997 el honorable consejo municipal legalizo la implementacion del ciclo de educacion basica secundari en esta institucion mediante resolucion 241 del 1 de Dic de 1999,emanada de la secretaria de educacion del departamento e la Guajira se aprueba los estudios correspondiente a los niveles de preescolar y los grados de 1 a 9 del nivel de educacion basica .
en el año 2003 mediante el decreto 250 del año 2002en el articulo 1 se conforman y organizan los establecimientos educativos del municipio de El Molino ,quedando la escuela San Lucas fusionada con el colegio Heliodoro Montero Duarte,conformando asi la Institucion Educativa Heliodoro Montero Duarte teniendo como rector al Lic. Marco Fidel Palomino Vence Nombrado bajo decreto N 005 del 2003 y como coordinadora la Lic.Deidad Luna Ibarra .
El Señor Rector de la Institucion Educativa Marcos Palomino Vence presento renuncia irrevocable en el mes de Abril de 2004, pasando a ocupar este cargo el especialista en administracion educativa Alberto Emilio Pinto por designacion de la secretaria de educacion departamental.
